Ao nível internacional, representa Kosovo Sub-17. A sua principal função em campo é Defesa.

Ao longo de Campeonato da Europa de Sub-19 da UEFA 2025-2026, edon krasniqi participou em 2 jogos e teve médias de 0 desarmes, 0 intercepções, 0 alívios e 0 remates bloqueados por jogo.