Está inscrito no Jong Genk e usa a camisola número 66. A sua principal função em campo é Avançado.

Durante a campanha 2025-2026 de Challenger Pro League belga, Jonathan Coenen fez 22 jogos, marcou 3 golos e somou 0 assistências. Teve média de 0.1 golos por jogo em 5 remates, com 3 à baliza.