Está inscrito no FK Neptunas Klaipėda e usa a camisola número 42. A sua principal função em campo é Avançado.

Durante a campanha 2025 de I Lyga lituana, Jonas Vaitkus fez 23 jogos, marcou 0 golos e somou 0 assistências. Teve média de 0 golos por jogo em 0 remates, com 0 à baliza.