Está inscrito no Marítimo e usa a camisola número 20. A sua principal função em campo é Avançado.

Durante a campanha 2025-2026 de Liga Portugal 2, Francisco Tomás Aguiar Gomes fez 21 jogos, marcou 1 golos e somou 1 assistências. Teve média de 0 golos por jogo em 6 remates, com 3 à baliza.