Ao nível internacional, representa Equador Sub-20. A sua principal função em campo é Médio. A sua avaliação de mercado estimada está actualmente em 150K €.

A sua transferência mais recente levou-o para CA Juventus (SP), vindo de Club Sport Emelec, através de , a 2026-01-01.

Em 2 presenças em Sul-Americano Sub-20 da CONMEBOL 2025, Elkin Munoz contribuiu com 0 golos e 0 assistências, completou 0 passes-chave em 0 passes totais e registou uma precisão de passe de -.