Ele pertence ao Jong Genk e usa a camisa número 66. Sua principal função em campo é Atacante.

Durante a campanha 2025-2026 de Liga Desafiante Pro Belga, Jonathan Coenen fez 22 partidas, marcou 3 gols e deu 0 assistências. Ele teve média de 0.1 gols por jogo em 5 finalizações, com 3 no alvo.