Ele pertence ao Carl Zeiss Jena e usa a camisa número 24. Sua principal função em campo é Meio-campo. Seu pé mais forte é Direito. Sua avaliação de mercado estimada atualmente é de 50K €.

Sua transferência mais recente o levou para Carl Zeiss Jena vindo de Carl Zeiss Jena U19 por em 2024-07-01.

Em 19 aparições em Regionalliga Alemã 2025-2026, Jannes Werner contribuiu com 0 gols e 0 assistências, completou 0 passes-chave de 0 passes totais e registrou precisão de passe de -.