Ele pertence ao Marítimo e usa a camisa número 20. Sua principal função em campo é Atacante.

Durante a campanha 2025-2026 de Liga Portugal 2, Francisco Tomás Aguiar Gomes fez 21 partidas, marcou 1 gols e deu 1 assistências. Ele teve média de 0 gols por jogo em 6 finalizações, com 3 no alvo.