Di level internasional, ia bermain untuk Kazakhstan U21. Posisi utamanya di lapangan adalah sebagai Penyerang.

Sepanjang musim Kualifikasi Kejuaraan Eropa U21 2025-2027, Y. Trufanov mencatat 4 penampilan, mencetak 0 gol, dan menyumbang 0 assist. Ia rata-rata membuat 0 gol per laga dari 1 percobaan, dengan 0 yang tepat sasaran.