Saat ini ia membela CSD Antofagasta dan mengenakan nomor punggung 25. Posisi utamanya di lapangan adalah sebagai Penjaga gawang. Estimasi nilai pasar terkininya berada di angka 50K .

Transfer terbarunya membuat ia bergabung dengan CSD Antofagasta dari Antofagasta U19 melalui skema pada 2020-01-01.

Di Primera B Chili 2026, Juan cisternas bermain dalam 2 pertandingan dengan rata-rata 0 intersepsi, 0 tekel, dan 0 sapuan per laga.