Saat ini ia membela Phonix Lubeck dan mengenakan nomor punggung 10. Posisi utamanya di lapangan adalah sebagai Penyerang. Estimasi nilai pasar terkininya berada di angka 125K €.

Transfer terbarunya membuat ia bergabung dengan Phonix Lubeck dari SV Eichede melalui skema pada 2022-07-01.

Sepanjang musim Liga Regional Jerman 2025-2026, Jonathan Stöver mencatat 3 penampilan, mencetak 2 gol, dan menyumbang 0 assist. Ia rata-rata membuat 0.7 gol per laga dari 0 percobaan, dengan 0 yang tepat sasaran.