Jonathan Núñez adalah pesepak bola profesional asal HON yang kini berusia 25 tahun. Saat ini ia membela CD Motagua dan mengenakan nomor punggung 32. Di level internasional, ia bermain untuk Honduras U23. Posisi utamanya di lapangan adalah sebagai Gelandang. Estimasi nilai pasar terkininya berada di angka 250K €.

Dalam 2 penampilan di Divisi Pertama Honduras 2025-2026, Jonathan Núñez menghasilkan 0 gol dan 0 assist, mencatat 0 umpan kunci dari total 0 umpan, serta membukukan akurasi passing -.