Saat ini ia membela Genk U23 dan mengenakan nomor punggung 66. Posisi utamanya di lapangan adalah sebagai Penyerang.

Sepanjang musim Divisi Kedua Belgia 2025-2026, Jonathan Coenen mencatat 22 penampilan, mencetak 3 gol, dan menyumbang 0 assist. Ia rata-rata membuat 0.1 gol per laga dari 5 percobaan, dengan 3 yang tepat sasaran.