Saat ini ia membela FC Kuressaare dan mengenakan nomor punggung 68. Posisi utamanya di lapangan adalah sebagai Bek. Estimasi nilai pasar terkininya berada di angka 50K €.

Transfer terbarunya membuat ia bergabung dengan FC Kuressaare dari Flora Tallinn II melalui skema Gratis pada 2026-03-02.

Selama Premier Liiga Estonia 2025, Johann Vahermägi tampil dalam 6 pertandingan dengan rata-rata 0 tekel, 0 intersepsi, 0 sapuan, dan 0 blok tembakan per laga.