Saat ini ia membela SL Benfica B dan mengenakan nomor punggung 55. Posisi utamanya di lapangan adalah sebagai Bek. Kaki terkuatnya adalah Kanan. Estimasi nilai pasar terkininya berada di angka 600K €.

Transfer terbarunya membuat ia bergabung dengan SL Benfica B dari Benfica U23 melalui skema pada 2024-08-01.

Selama Liga Segunda Portugal 2025-2026, João Fonseca tampil dalam 20 pertandingan dengan rata-rata 1.1 tekel, 1 intersepsi, 2.9 sapuan, dan 0.2 blok tembakan per laga.