Saat ini ia membela BK Frem dan mengenakan nomor punggung 3. Posisi utamanya di lapangan adalah sebagai Bek.

Transfer terbarunya membuat ia bergabung dengan BK Frem dari FC Svendborg melalui skema pada 2020-08-01.

Selama Piala Denmark 2024-2025, Emil Schou Jørgensen tampil dalam 4 pertandingan dengan rata-rata 0.5 tekel, 1 intersepsi, 1 sapuan, dan 0 blok tembakan per laga.