Di level internasional, ia bermain untuk Nikaragua. Posisi utamanya di lapangan adalah sebagai Penyerang.

Sepanjang musim Liga Primera Nikaragua 2026, Efraín Mejía mencatat 7 penampilan, mencetak 0 gol, dan menyumbang 0 assist. Ia rata-rata membuat 0 gol per laga dari 0 percobaan, dengan 0 yang tepat sasaran.