Saat ini ia membela Real CD Espana dan mengenakan nomor punggung 28. Posisi utamanya di lapangan adalah sebagai Bek. Kaki terkuatnya adalah Kanan. Estimasi nilai pasar terkininya berada di angka 250K €.

Transfer terbarunya membuat ia bergabung dengan Real Espana dari CD Choloma melalui skema Gratis pada 2020-07-01.

Selama Divisi Pertama Honduras 2025-2026, Carlos Mejía tampil dalam 32 pertandingan dengan rata-rata 0 tekel, 0 intersepsi, 0 sapuan, dan 0 blok tembakan per laga.