Di level internasional, ia bermain untuk Eswatini. Posisi utamanya di lapangan adalah sebagai Bek.

Transfer terbarunya membuat ia bergabung dengan Mbabane Swallows dari melalui skema pada 2024-08-14.

Selama Kualifikasi Kejuaraan Dunia, Afrika 2026, Bongi Magagula tampil dalam 4 pertandingan dengan rata-rata 0 tekel, 0 intersepsi, 0 sapuan, dan 0 blok tembakan per laga.