Di level internasional, ia bermain untuk Mongolia. Posisi utamanya di lapangan adalah sebagai Gelandang.

Dalam 1 penampilan di Asian Cup 2027, Batzaya Amgalanbat menghasilkan 0 gol dan 0 assist, mencatat 0 umpan kunci dari total 0 umpan, serta membukukan akurasi passing -.