Saat ini ia membela Real Santa Cruz dan mengenakan nomor punggung 39. Posisi utamanya di lapangan adalah sebagai Gelandang.

Transfer terbarunya membuat ia bergabung dengan Real Santa Cruz dari Royal Pari Fútbol Club II melalui skema pada 2023-03-29.

Dalam 27 penampilan di Divisi Pertama Bolivia 2024, Gerson Malgor menghasilkan 0 gol dan 0 assist, mencatat 0 umpan kunci dari total 0 umpan, serta membukukan akurasi passing -.