Juan Ayqque es un futbolista profesional de PER y actualmente tiene 23 años. Forma parte de FBC Melgar y lleva la camiseta número 34. Su función principal en el campo es Defensor. Mide 173 cm y pesa 65 kg. Su valoración de mercado estimada se sitúa actualmente en 50K €.

Su último traspaso lo llevó a FBC Melgar desde EM Deportivo Binacional mediante Préstamo el 2025-12-31.

A lo largo de Liga 1 de Perú 2025, Juan Ayqque jugó 13 partidos y promedió 0.6 entradas, 0.3 intercepciones, 0.2 despejes y 0 tiros bloqueados por partido.