Forma parte de Atlético Morelia y lleva la camiseta número 28. Su función principal en el campo es Delantero. Mide 180 cm y pesa 80 kg.

Durante la campaña 2025-2026 de Ascenso MX de México, José Flores disputó 11 partidos, marcó 6 goles y dio 0 asistencias. Promedió 0.5 goles por partido con 0 tiros, de los cuales 0 fueron a puerta.