Jonathan Villagra es un futbolista profesional de CHI y actualmente tiene 25 años. Forma parte de Colo Colo y lleva la camiseta número 2. A nivel internacional, juega para Chile Sub-23. Su función principal en el campo es Defensor. Su pie más fuerte es Derecho. Su valoración de mercado estimada se sitúa actualmente en 1000K €.

Su último traspaso lo llevó a Colo Colo desde Union Espanola mediante Fichaje Libre el 2024-08-08. La operación se reportó en 0.4M €.

A lo largo de Liga de Primera de Chile 2026, Jonathan Villagra jugó 5 partidos y promedió 1.4 entradas, 2 intercepciones, 5.2 despejes y 0 tiros bloqueados por partido.