Forma parte de FC Kuressaare y lleva la camiseta número 68. Su función principal en el campo es Defensor. Su valoración de mercado estimada se sitúa actualmente en 50K €.

Su último traspaso lo llevó a FC Kuressaare desde Flora Tallinn II mediante Fichaje Libre el 2026-03-02.

A lo largo de Premium Liiga de Estonia 2025, Johann Vahermägi jugó 6 partidos y promedió 0 entradas, 0 intercepciones, 0 despejes y 0 tiros bloqueados por partido.